蛋白质是细胞、组织、器官的重要组成成分，蛋白质作为生物大分子能触发和介导众多信号通路以执行机体功能，对蛋白质的研究可以揭示机体功能信息，疾病途径以及基因表达特征。

当研究蛋白质时首要的挑战便是如何从样品中获取蛋白质，而蛋白质提取过程势必会涉及到细胞破碎——即破坏细胞壁和/或细胞膜，使胞内产物获得更大程度的释放，再通过不同的离心力及时间将处于细胞不同位置的蛋白释放出来，溶入已知成分的溶液内。该步骤是蛋白质初级分离纯化阶段的重要环节，它直接影响产物的回收率，也可能影响产物的纯度。

先将剪碎的组织置于管中，再套入研杆来回研磨，上下移动，即可将细胞研碎。匀浆器的研钵磨球和玻璃管内壁之间间隙保持在十分之几毫米距离，此法适用于小样本量动物脏器组织。
存在的问题：韧性组织如心肌、韧带、肌腱等易造成堵塞，质地坚硬样品如骨骼等易损伤匀浆阀。

研磨法原理：借助研磨中磨料（常用磨料为石英砂、氧化铝）和细胞间的剪切及碰撞作用破碎细胞。

该法主要用于植物组织和细菌的细胞破碎，部分动物组织也适用，研磨时需加少量液氮以保证低温状态防止蛋白降解，操作务必小心谨慎。

珠磨法属于研磨法的扩展，利用研磨珠与细胞悬浮液一起快速搅拌，由于研磨作用，使细胞获得破碎，珠磨破碎过程中会产生大量的热能，在设计操作时应充分考虑换热能力，此法适用于小样本量的组织样品。

原理：强声波作用溶液时，气泡产生、长大、破碎和空化现象引起冲击波和剪切力使细胞裂解，超声波的破碎效率取决于声频、声能、处理时间、细胞浓度和细胞类型等。

超声破碎常用于脑组织匀浆和细胞破碎，在操作过程中会产生大量的热，因此需在冰水或有外部冷却的容器中进行，但是空化作用产生的活性氧自由基会使某些敏感性活性物质变性失活，同时超声产生的泡沫使蛋白与空气接触增多可能会导致部分蛋白的降解（一些蛋白的泛素化依赖于氧化，如HIF-1α）。